Le poste est proposé dans le cadre de l'ambition française de devenir un leader des biothérapies innovantes et de la bioproduction en s'appuyant sur un programme d'équipements de recherche prioritaire (PEPR) copiloté par le CEA et l'INSERM. Vous participerez à l'ingénierie des domaines d'immunoglobulines afin d'améliorer la bioproduction d'anticorps bi-spécifiques en favorisant l'appariement des chaînes hétérodimères par rapport aux homodimères. Les interactions chaîne lourde/chaîne lourde (CH3/CH3) et chaîne lourde/chaîne légère (CH1/CL) doivent être ciblées pour la construction de bibliothèques et la propension à l'hétérodimérisation des paires de variants sera évaluée à l'aide d'un pipeline mixte (en utilisant approches biotechnologiques et bioinformatiques) développées par notre équipe et nos partenaires. En bref, le pipeline est conçu pour cribler, en haut débit, une librairie de variants contre une autre librairie et est basé sur le couplage de : i) un système quantitatif bactérien à deux hybrides (qB2H) qui corrèle la force de l'interaction protéine-protéine (PPI) avec la survie cellulaire ; ii) NGS à lecture longue (PacBio HiFi) et à lecture courte (Illumina) et ; iii) script python pour l'analyse des données. Les résultats devraient permettre d'avoir un aperçu des paires de variantes prometteuses qui devraient être produites sous forme d'anticorps complets chez les cellules de mammifères pour validation.

MISSIONS:

• Construire des bibliothèques de variantes en utilisant une approche de biologie moléculaire appropriée (Golden Gate, Gibson, restriction/ligation, etc.)
• Effectuer des tests/sélections par qB2H
• Préparer des échantillons d'ADN pour NGS
• Interpréter les résultats de l'analyse des données
• Produire des paires prometteuses de variants dans les cellules de mammifères et les caractériser

PROFIL:

Concernant les compétences techniques, nous recherchons des candidats ayant une solide expérience en biologie moléculaire et familiarisés avec la culture de cellules microbiennes et de mammifère. Une expérience antérieure dans un ou plusieurs des domaines suivants sera avantageuse : systèmes à double hybrides, préparation d'échantillons NGS, production de protéines dans des cellules de mammifères et caractérisation biochimique. En ce qui concerne les compétences générales, le candidat doit être organisé et fiable, avoir un esprit critique et une bonne communication (pour les présentations et la rédaction de rapports ou de publications), être capable de travailler en équipe et être motivé pour amener le projet multidisciplinaire aux résultats attendus. Aptitude linguistique : l'anglais et le français sont adéquats à exécution de ce projet.